2007年，三峽庫區水環境質量監測內容包括長江干支流水質監測和一級支流水華監測。水質評價執行《地表水環境質量標準》（GB 3838-2002），水體綜合營養狀態評價執行中國環境監測總站制定的“湖泊(水庫)富營養化評價方法及分級技術規定”。
　　
5.1 庫區水質監測
　　
　　2007年，在庫區長江干支流共布設13個水質監測斷面，其中乾流斷面6個，分別為重慶朱沱、銅罐驛、寸灘、涪陵清溪場、萬州沱口和巴東官渡口；一級支流斷面7個，分別為嘉陵江北碚、臨江門、烏江武隆、禦臨河口、澎溪河口、大寧河口和香溪河口。水質評價項目共13項，包括pH、溶解氧、高錳酸鹽指數、五日生化需氧量、氨氮、石油類、總磷、汞、鎘、砷、銅、鉛和鉻(六價)。
　　
5.1.1 幹流水質
　　
　　2007年，庫區幹流水質好于上年。在6個斷面中，沱口、官渡口斷面水質為Ⅱ類，朱沱、銅罐驛、寸灘、清溪場等4個斷面水質均為Ⅲ類。其中，朱沱、寸灘斷面水質由上年的Ⅳ類變為Ⅲ類，其餘4個斷面水質類別保持不變。
　　
　　從各月情況來看，2∼5月和10月水質最好，各斷面各月水質均為Ⅱ、Ⅲ類。1月、11月和12月水質較好，各有1個斷面受石油類影響水質為Ⅳ類，各月其餘5個斷面水質均為Ⅱ、Ⅲ類；6月、9月水質較差，其中6月有2個斷面受石油類影響水質為Ⅴ類，9月有3個斷面受總磷影響水質為Ⅳ類；7月和8月水質最差，總磷、高錳酸鹽指數和石油類為主要影響因子。

　表5-1　2007年三峽庫區長江幹流斷面水質類別

5.1.2 支流水質
　　
　　2007年，庫區支流水質較差，但略好于上年。7個斷面中，北碚斷面水質為Ⅱ類，臨江門、武隆斷面水質為Ⅲ類，其餘4個河口斷面受總磷影響水質均為Ⅳ類。其中，北碚斷面水質由上年的Ⅲ類轉為Ⅱ類，臨江門斷面水質由上年的Ⅳ類轉為Ⅲ類。
　　
　　從各月情況來看，每月至少有2個斷面超標（Ⅲ類），水質達標的斷面比例變化在28.6%∼71.4%之間，4個河口斷面受總磷影響超標現象十分普遍。

　　表5-3　2007年三峽庫區長江一級支流斷面水質類別

　注：河口斷面水質評價執行《地表水環境質量標準》(GB 3838-2002)湖庫標準。

　表5-4　2007年三峽庫區長江一級支流斷面水質類別比例（%）